En el año 2001 un grupo de empresarios observaron que a pesar de la corta edad de la Ciudad de Mexicali se había experimentado un rápido crecimiento económico en los últimos 30 años con el cambio del Sector Agropecuario al Industrial acompañado de la alta tecnología e importaciones de productos extranjeros, generando desempleo y cierre de micros y pequeñas empresas por la falta de competitividad y visión empresarial. Esta situación no había sido completamente aprovechada por empresarios locales, pero si por empresarios foráneos, estableciendo grandes empresas y franquicias que han venido a desplazar a pequeños empresarios locales.
A continuación se presenta el crecimiento que ha tenido EmpreSer desde sus inicios:
EmpreSer a lo largo de su historia se ha financiado con recursos de los Gobiernos Estatales y por la Secretaría de Economía Federal (SE) para equipamiento y operación del programa, ya que EmpreSer cuenta con una gran demanda, misma que no se satisface en su totalidad por la falta de recursos e infraestructura.